1992-93赛季,小牛队把希望都寄予在年轻人的身上,不过那其中并不包括在第四顺位选择的新人吉姆·杰克逊。他和球队老板在合同问题上出现很大的分歧,这导致了他在长达半个赛季的时间里被排在球队大名单之外。由于老球员的离开,年轻人还没有及时的顶上来,小牛在1992-93赛季根本没有在NBA竞争的实力。随着赛季的进行,重建中的小牛离创造NBA历史的最差战绩越来越近。之前最差的战绩是76人在1972-73赛季创造的9-73。而在61场比赛结束后,小牛的战绩只有4胜57负。最终小牛队的战绩定格为11-71。
1993年至1999年
1993-94赛季,小牛队在1993年NBA选秀中,在第六顺位选择肯塔基大学的贾马尔·马什本。这个全能的6尺8前锋被希望能够给前场的得分带来帮助,并且组成球队的新核心。在1993-94赛季,小牛队的开局只有1胜23负,在一月结束的时候也只有3胜40负。在赛季结束的时候,小牛队解雇巴克纳,并重新请回迪克·莫塔,球队历史上的第一任,并且打造了80年代球队辉煌的教练。
1994-95赛季,小牛队取得显著的变化。在1993-94赛季的战绩只有13-69之后,球队战绩在这一赛季进步23场,变成36胜46负,是NBA历史上进步最大的进步幅度。球队进步最主要的催化剂是新秀控卫贾森·基德,4次三双是NBA最多的,并且场均得到11.7分,5.4个篮板和7.7次助攻。基德还和贾马尔·马什本以及吉姆·杰克逊成为全联盟攻击火力最强的三人组。
1995-96赛季,在经历了一个不错的1994-95赛季之后,小牛队取得令人失望的26胜。迪克·莫塔第二次执教小牛队的经历就此结束。在仅仅18场比赛之后,贾马尔·马什本就因为要进行左膝手术结束整个赛季。杰克逊和基德在有些时候不能很好的配合,但是他们俩各自分别有明星级的表现都不是问题。基德成为小牛第一位全明星首发,最终在助攻榜上排名第二(9.7次),抢断榜排名第四(2.2次)。杰克逊成为球队的得分王,并且是仅有的一位打满全部82场比赛的球员。
1996-97赛季开始时,小牛队阵中有著名的达拉斯三杰和乐观的新主教练。但在赛季结束的时候,贾森·基德, 贾马尔·马什本和吉姆·杰克逊都有了新的东家。缺乏连续性让小牛队只取得24胜58负的战绩。
1997-98赛季,达拉斯小牛队在这个赛季的战绩是20胜62负,但是小牛队却在整个赛季拿下了最不可能取得的胜利。在1997年11月1日主场的揭幕战中击败了超音速队,在最后5分01秒时间内打了对手一个23-2的高潮,最终以89-81获得胜利。在1997年12月4日,当达拉斯小牛队还在4胜12负的战绩面前挣扎时,总经理唐·尼尔森将主教练吉姆·克里门斯解约,亲自出马。
1998-99赛季,尽管小牛队的战绩只有区区19胜31负,但是小牛队自1989-90赛季之后第一次在主场胜多负少:15胜10负。小牛队在4月取得了8胜7负的良好战绩,其中还击败季后赛球队马刺队、太阳队、森林狼队和火箭队(两次)。后卫迈克尔·芬利已经逐渐成为升起的新星,平均每场能攻下20.2分,也成为NBA仅有的在缩水赛季里总分达到1000分的10名球员之一。
1999年至2004年
1999-00赛季,小牛队看到了复兴的曙光,在常规赛中取得40胜42负,距离进入季后赛仅一步之遥。仅仅进入NBA两年的德克·诺维茨基表现日益出众,而在管理层IT产业大亨马克·库班成为小牛队的新老板。
2000-01赛季,小牛队的常规赛战绩为53胜29负,在自1990年之后重新进入季后赛。德克·诺维茨基成为球队的中流砥柱。在季后赛第一轮,小牛队在0-2落后的局面下,连胜3场,淘汰犹他爵士队,进入了第二轮。但来到第二轮,在马刺队面前,稚嫩的小牛队以1比4落败。
2001-02赛季,小牛队搬到新的球馆——美国航线体育馆,球队战绩再上一层楼,取得创球队历史记录的57胜。由于在赛季中期,球队成绩西部第一,小牛队主教练唐·尼尔森还成为西部全明星队主教练。在季后赛,小牛队第一轮以3-0轻取明尼苏达森林狼队,但在第二轮小牛队以2-4败给萨克拉门托国王队。
2002-03赛季,小牛队队形成德克·诺维茨基、迈克尔·芬利和史蒂夫·纳什为核心的阵容,又迎来了拉弗朗茨和范埃克塞尔球队实力大增,小牛队以14连胜开局并继续扩大胜绩,将57胜变为60胜,在先后以两个4:3淘汰开拓者队和国王队后再次杀到西部决赛,但是仍以2-4的总比分惨遭当年的总冠军马刺的阻挡。
2003-04赛季,小牛队获得52胜30负的战绩,但在季后赛首轮就被国王队以4-1淘汰。赛季结束后,纳什转会太阳队;唐·尼尔森离开小牛队,转往勇士队执教。2004-05赛季,小牛队斩获58胜24负,在季后赛首轮以4-3淘汰拥有姚麦组合的火箭队,但在第二轮则以2-4不敌由昔日队员史蒂夫·纳什领衔的太阳队。赛季结束后,迈克尔·芬利转投加盟马刺队。